馬祖的傳統聚落以石砌疊牆、福州杉為樑柱、石瓦為頂，石牆上偶有"落水頭"，多以鯉魚造型，粗曠中含有巧思趣味。
馬祖最為人稱道的傳統聚落為北竿鄉的芹壁村，有亞洲地中海的美譽。此外，南竿的牛角聚落、鐵板村、津沙聚落，東莒的福正村、大埔村等，也都保有傳統聚落的樣貌，而成為遊客喜愛拍攝的主題。
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