上圖：陳仲玉、馬祖民俗文物館提供
過去由語言學家根據語言中同源詞來判斷語系、並推論整個大洋洲：東至夏威夷，西至婆羅洲、北至台灣，南至紐西蘭的諸多民族，包含台灣原住民族，具有相當的語言相似性，可稱為「南島語族」（Austronesian）。 而這些南島語族的根源何在，長期以來學者們有各種推論。有一說是民國39年，中央研究院的凌純聲教授就從中國古書中去找東南亞各民族的來源，而在〈東南亞古文化研究發凡〉一文中，根據文化的特質與古史的記載，特別是三國時東吳沈瑩所著的《臨海水土志》一書的記載，來證明「台灣土著民族與古代閩越人是同一文化系統的民族」，即台灣土著並不是新入的馬來系，而是在古代與原來廣義的苗族同一民族居於中國大陸長江之南，屬於同系的越濮（或越獠）民族， 意思是：今日台灣原住民族，是由閩越一帶遷入。
近世在南島語族研究上，還有施得樂（Richard Shutler）與馬爾克（Jeffrey Marck）於1975年發表論文「關於會耕種的南島人擴散的討論」〈On the Dispersal of the Austronesian Horticulturalists〉，在南島語族的親屬關係上之後根據若干語言與考古的材料以及對於這些材料的解釋，再加上戴恩（Isidore Dyen）的語言分佈與遷移學說，認為：南島的共同母語的起源地在亞洲南部，即華南與中南半島北部一帶。此與凌純聲先生的假設類同，但在這個南島民族起源假說模型下的遷徙途徑，即中國東南沿海一帶的史前遺址長久以來缺乏更有力的出土證據
過去推論認為，南島語族約在距今五、六千年前開始向海外遷移，但在距今八千多年前的亮島人出土後，南島語族向海外擴張的年代或許也可向上修訂至距今八千年，這項最新的證據也為該區域人群的擴張及移動路徑與南島語族起源問題，從生物人類學的角度提供嶄新的科學證據。
此外，兩具亮島人骨經萃取後送至德國萊比錫的馬克斯.普朗克演化研究中心（Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology）做去氧核醣核酸粒線體(mtDNA)序列比對的發現，亮島人一號屬於E單倍群（haplogroup E）；亮島人二號屬於R9單倍群（haplogroup R9），與台灣泰雅、阿美及東南亞部分島嶼族群的遺傳血緣相近。足可證實古代亞洲大陸東南一帶，確實存在與台灣原住民有相同母系血緣的人種。這個成果乃是目前亞洲大陸東南沿海一帶古代粒線體 DNA 序列中，最完整且年代較早的二筆資料。此為國際南島語族發展、起源理論的重要發現：這兩筆資料反映了亞洲大陸東南一帶可能是近一萬年以來所謂「原南島語族」的祖居地之一。這個最新的證據也為該區域人群的擴張及移動路徑與南島語族起源問題，從生物人類學的角度提供嶄新的科學證據。