乾隆五十七年應鄉試中舉人，翌年赴京會試未第。後回長樂任吳航書院主講，并授醫學兼理醫業。由於醫術高明，醫德高尚，遠近知名。嘉慶三年（1798）主講泉州清源書院，嘉慶五年再度上京應試，不第，翌年參加大挑，成績甲等，以知縣分發直隸保陽（今河北省保定）候補。時值盛夏，保陽瘟疫流行，其用淺顯韻語編成「時方歌括」教醫生按法施治，救活甚眾。嘉慶七年秋（1802）丁母懮，回籍守制，專心著書治病以濟世。
嘉慶十三年服除赴京受職，仍候命於保陽。時河北省婦女常患「陽挺症」（子宮脫垂），其親授醫理予諸醫，調制方藥以止病發。候補三年間，著有「傷寒淺著」十二卷、「金匱淺注」等書。
嘉慶十七年改署磁州任棗強，升同知，擢代理下定知府；公務雖繁忙，仍不斷撰寫醫書，為人治病。嘉慶二十四年，年已六十七歲，倦宦海浮沉，遂以年老請休，回福州，在福州石井巷井上草堂講學，培養醫學人才。道光三年（1823）病卒，享年七十一歲，葬於江田溪湄村山麓。
陳氏醫學著作傳世很多，有「靈素節要淺」、「金匱要略淺注」、「金匱方歌括」、「傷寒論淺注」、「長沙方歌括」、「醫學實在易」…等十六種，合刋為『南雅堂醫書全集』。具有以黃帝內經，神農本草經為基礎，以傷寒論，金匱要略為中心。全書內容十分完備，包括診斷、方劑、藥物和各種病症的治療； 寫法深入淺出，易讀易記。近二百年來好評歷久不衰，對中醫教育的普及起了很大推動作用。
2017.04.05.
